Jupyter notebook 无法使用 parse_args() 函数的解决方法

左手的ㄟ右手 2023-01-24 04:30 27阅读 0赞

### 目录 ###

*  前言
 *  1. 问题所示
 *  2. 函数形参（suc）
 *  3. 去除函数（suc）

# 前言 #

原本在pycharm执行的代码，想拆分放到jupyter notebook执行  
特别是命令行参数传输的这个参数会出现bug

对应命令行获取参数的讲解可看我这篇文章：[python中argparse模块关于 parse\_args() 函数详解（全）][python_argparse_ parse_args_]

对应 `parse_args`函数代码如下：

def parse_args():
        parser = argparse.ArgumentParser(
            description='训练')
        parser.add_argument('-t', '--title', help='the name of running experiment',
                            dest='title',
                            default=None,
                            type=str
                            )
        parser.add_argument('-ppi', '--ppi', help='the chosen type of PPI',
                            dest='ppi',
                            default='CPDB',
                            type=str
                            )
        # 其他参数，此处省略
        
        args = parser.parse_args()
        return args

# 1. 问题所示 #

在jupyter notebook执行该行命令：`args = parse_args()`  
出现的bug如下所示：

usage: ipykernel_launcher.py [-h] [-t TITLE] [-ppi PPI] [-omic OMIC]
                                 [-cancer CANCER] [-e EPOCHS] [-p PATIENCE]
                                 [-dp DP] [-lr LR] [-wd WD] [-hs1 HS1] [-hs2 HS2]
                                 [-thr_go THR_GO] [-thr_seq THR_SEQ]
                                 [-thr_exp THR_EXP] [-thr_path THR_PATH]
                                 [-seed SEED]
    ipykernel_launcher.py: error: unrecognized arguments: -f /home/kkjz/.local/share/jupyter/runtime/kernel-9aeb050b-0615-4455-bcd0-e34169f0f932.json
    An exception has occurred, use %tb to see the full traceback.
    
    SystemExit: 2
    
    
    /home/kkjz/anaconda3/envs/py38/lib/python3.8/site-packages/IPython/core/interactiveshell.py:3406: UserWarning: To exit: use 'exit', 'quit', or Ctrl-D.
      warn("To exit: use 'exit', 'quit', or Ctrl-D.", stacklevel=1)

截图如下：  
![在这里插入图片描述][ed6ff3994ee744db8bd2c1dc828f9f86.png]

# 2. 函数形参（suc） #

**原因：本身应该赋值一些参数传入，此处没有参数传入导致无法编译成功**

将其改为如下：`args = parse_args(args=['-t','output', '-ppi', 'CPDB'])`，对应赋值，并且转换为列表传入（依旧不行）  
结果如下：  
![在这里插入图片描述][cca99bf3550346d7814c7716a8fadbe8.png]

深究其原因发现原函数代码没有args的参数，对应需要改写原函数参数  
函数修改如下：

# 修改第一处，传入的参数
    def parse_args(args):
        parser = argparse.ArgumentParser(
            description='训练')
        parser.add_argument('-t', '--title', help='the name of running experiment',
                            dest='title',
                            default=None,
                            type=str
                            )
        parser.add_argument('-ppi', '--ppi', help='the chosen type of PPI',
                            dest='ppi',
                            default='CPDB',
                            type=str
                            )
        # 其他参数，此处省略
        
        # 修改第二处，传入的参数
        args = parser.parse_args(args)
        return args

对应重新编译成功：  
![在这里插入图片描述][1b6913a204084e6986e45a4ffcf6f49a.png]

# 3. 去除函数（suc） #

既然函数的传参有问题，又不知道怎么放  
直接将其函数去除

对应如下：

# 整体前面的函数不要。python记得去除缩进
    parser = argparse.ArgumentParser(
        description='训练')
    parser.add_argument('-t', '--title', help='the name of running experiment',
                        dest='title',
                        default=None,
                        type=str
                        )
    parser.add_argument('-ppi', '--ppi', help='the chosen type of PPI',
                        dest='ppi',
                        default='CPDB',
                        type=str
                        )
    # 其他参数，此处省略

函数调用变为：`args = parser.parse_args(args=['-t','output', '-ppi', 'CPDB'])`，（注意与上面的区别）

最后截图如下：  
![在这里插入图片描述][0c61179e565a477d88e70102050f7d27.png]

[python_argparse_ parse_args_]: https://blog.csdn.net/weixin_47872288/article/details/127801655
[ed6ff3994ee744db8bd2c1dc828f9f86.png]: /images/20221119/63048c1e03274e4a9b202f971018118c.png
[cca99bf3550346d7814c7716a8fadbe8.png]: /images/20221119/7389a141242b4af4a7c286560a7cff36.png
[1b6913a204084e6986e45a4ffcf6f49a.png]: /images/20221119/e703abf5e8134f8ba79931d08919dd18.png
[0c61179e565a477d88e70102050f7d27.png]: /images/20221119/40e94bf404d14136895173907dcef7ce.png