Ubuntu维护7 conda环境全解_python_jupyter

绝地灬酷狼 2022-12-04 09:09 595阅读 0赞

**建议:**  
**不管是win10系统还是Ubuntu系统,  
如要使用python, 直接在Ubuntu上安装miniconda,  
创建conda环境进行使用  
(该方案是最简洁, 最安全, 最完美的python运行环境创建思路)**

*  安装Ubuntu之后, 不要管系统自带的Python,因为版本很难控制
 *  直接下载安装anconda `wget https://repo.continuum.io/archive/Anaconda3-2018.12-Linux-x86_64.sh`
 *  安装好后配置更新conda下载源和pip更新到最新, 然后在创建环境 ,或者使用默认的conda用户
 *  此时此刻系统里面的Python理论上就都是conda的了
 *  然后创建python环境开始使用, 在强调一哈不建议更改本地python和conda自带python
 *  不建议更改本地python和conda自带python
 *  不建议更改本地python和conda自带python
 *  **不建议更改本地python和conda自带python**

2020/11/17更新:  
今日因为挂V7N, 直接导致网络出错, 在创建conda环境时出错, 然后按照网上的逻辑删除了`~/.condarc`, 导致整个conda崩盘, 只得重新安装  
[这是一个安装miniconda的教程里面写的很清楚一些细节][miniconda]

### 文章目录 ###

*  一. conda
 *   *  1.1 介绍conda
     *  1.2 conda下载安装, 下面命令建议全部执行
     *  1.3 conda使用
     *  1.4 创建环境出现的问题
 *  二. 系统自带的Python, 不建议使用
 *   *  2.1 下载安装 修改下载源
     *  2.2 pip和pip3的区别
     *  2.3 设置Ubuntu默认启动为python3
 *  三. pycharm
 *   *  3.1 pycharm python编译器下载安装
     *  3.2 建立软链接,pycharm安装
 *  3.4 win10安装pycharm教育版使用子系统Ubuntu的conda的环境
 *   *  a. 去pycharm官网注册教育版
     *  b. 在选择环境的时候, 选择Ubuntu中conda环境也很简单
     *  c. 利用pycharm的好处就是
 *  四. anconda与本地python冲突解决
 *  五. \`jupyter notebook\`
 *   *  5.1 jupyter在conda环境中使用
     *  5.2 jupyter登录密码设置
     *  5.3 jupyter常用快捷键
 *  六. 老Ubuntu安装Python3.6
 *  七. python包管理
 *  问题汇总
 *   *  a. jupyter无法补全

本文主要从两个方面介绍python

conda和python图示  
![在这里插入图片描述][watermark_type_ZmFuZ3poZW5naGVpdGk_shadow_10_text_aHR0cHM6Ly9ibG9nLmNzZG4ubmV0L3FxXzMyNDYwODE5_size_16_color_FFFFFF_t_70_pic_center]

# 一. conda #

## 1.1 介绍conda ##

*  conda是一个python版本和环境的管理工具
 *  可以通过conda创建全新的python环境, 而新创建的python环境里面的python版本和包与外面的没有任何冲突

## 1.2 conda下载安装, 下面命令建议全部执行 ##

--------------------

**第一部分是安装完全版conda, 软件较大,雍容华贵**

**建议使用第二种方法安装mini版本的conda**

wget https://repo.continuum.io/archive/Anaconda3-2018.12-Linux-x86_64.sh
    chmod 777 anaconda*.sh # 转化为可执行文件
    sudo ./anaconda*.sh # 安装 注意注意 这里第一个yes之后就不要轻易按回车
    Do you wish the installer to initialize Anaconda3
    in your /home/user1/.bashrc ? [yes|no]
    [no] >>> yes 
    # 注意::注意
    # 这里千万别多按回车,因为下面会问到是否安装到本地环境变量, 如果按了回车默认是不加入本地变量,就会很尴尬 , 
    # 另外注意这里既是添加到了本地环境变量, 依然需要执行以下source ~/.bashrc, 只有执行了这系统才能识别conda
    Do you wish to proceed with the installation of Microsoft VSCode? [yes|no]
    >>> no
    # 到这里就已经安装完毕, 
    # 但是此时使用 conda还没有效果, 为何呢, 因为虽然安装了也将conda的环境变量加入到了系统中,但是系统环境变量还没有生效; 因此需要运行下面命令才能生效
    source ~/.bashrc
    
    # 如果在安装过程中没有选择直接加入环境变量,请将下面命令运行一下
    echo 'export PATH="/home/user01/anaconda/bin:$PATH"' >> ~/.bashrc
    source ~/.bashrc
    
    # 设置conda下载源, 这样在新建用户时会降低出错概率
    conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/ # 这是清华大学下载源
    conda config --set show_channel_urls yes # 设置搜索显示地址
    
    # 更新pip
    pip install --upgrade pip # 如果这个报错就执行下面到命令
    pip install --upgrade pip --user
    
    # 设置pip默认下载源
    pip config set global.index-url https://mirrors.aliyun.com/pypi/simple/
    # 也可以每次单独pip下载包的时候制定下载源 
    pip install numpy==1.14.0 -i https://mirrors.aliyun.com/pypi/simple/

**第二部分是安装迷你版conda, 软件100M,较小, 还年轻**

wget -c https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
    chmod 777 Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh #给执行权限
    ./Miniconda3-l*
    yes # 确定安装条例
    yes # 确定将conda加入到系统
    source ~/.bashrc # 激活
    
    # 下面四条是下载源
    conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
    conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
    conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
    conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
    conda config --set show_channel_urls yes  # 显示路径
    conda config --get channels # 查看通道
    cat ~/.condarc #查看 添加的路径保存位置

## 1.3 conda使用 ##

# conda环境的一些操作
    conda create -n mypy python=3.6 # 创建名字为mypy的环境
    conda env list # 显示环境列表
    source activate mypy # 进入环境
    source deactivate #退出环境
    conda create -n mypy_new --clone mypy  # 克隆mypy环境
    conda remove -n mypy--all # 删除mypy环境

## 1.4 创建环境出现的问题 ##

先自查网络

*  移除`mv ~/.condarc ~/.condarc_old`

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
    conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
    conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
    conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
    conda config --set show_channel_urls yes  # 显示路径
    conda config --get channels # 查看通道

此时新生成`~/.condarc`  
`conda install jupyter` 还是会出错  
那就在试试`conda install -c conda-forge jupyter`

# 二. 系统自带的Python, 不建议使用 #

## 2.1 下载安装 修改下载源 ##

sudo apt install python3-pip  # 安装python3
    pip3 install pip # Python3自带pip3, 安装pip
    -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple  # 可以在pip后面加入用于修改下载源
    sudo apt install python-pip # 安装pip
    
    # 修改下载源永久使用
    pip install pip -U
    pip config set global.index-url https://mirrors.aliyun.com/pypi/simple/
    
    # 其他源
    阿里云 http://mirrors.aliyun.com/pypi/simple/ 
    中国科技大学 https://pypi.mirrors.ustc.edu.cn/simple/ 
    豆瓣(douban) http://pypi.douban.com/simple/ 
    清华大学 https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple/ 
    中国科学技术大学 http://pypi.mirrors.ustc.edu.cn/simple/

## 2.2 pip和pip3的区别 ##

[转自pip中pip和pip3的区别][pip_pip_pip3]

*  pip是python的包管理工具，pip和pip3版本不同，都位于Scripts\\目录下：
 *  如果系统中只安装了Python2，那么就只能使用pip。
 *  如果系统中只安装了Python3，那么既可以使用pip也可以使用pip3，二者是等价的。
 *  如果系统中同时安装了Python2和Python3，则pip默认给Python2用，pip3指定给Python3用。
 *  重要：虚拟环境中，若只存在一个python版本，可以认为在用系统中pip和pip3命令都是相同的

## 2.3 设置Ubuntu默认启动为python3 ##

zjq@zjq:~$ sudo update-alternatives --install /usr/bin/python python /usr/bin/python3 150
    [sudo] zjq 的密码： 
    update-alternatives: 使用 /usr/bin/python3 来在自动模式中提供 /usr/bin/python (python)

[update-alternatives介绍][update-alternatives]  
update-alternatives 可以创建、删除、修复、软连接，还能显示出已存在软连接的信息，而所有的这些就构成了备选方案系统（alternatives system）。  
update-alternatives是用来维护系统命令的符号链接，以决定系统默认使用什么命令，可以设置系统默认加载的首选程序  
比如我系统已安装有java 1.6，还想要安装java 1.7，但我不想卸载java 1.6。就可以通过update-alternatives --config在多个java版本间进程切换。update-alternatives是用于在多个同类型命令中进行切换的一个命令。

# 三. pycharm #

## 3.1 pycharm python编译器下载安装 ##

[社区版本下载链接][Link 1]  
左侧黑色Download社区版本, 不需要激活可以直接使用  
![在这里插入图片描述][watermark_type_ZmFuZ3poZW5naGVpdGk_shadow_10_text_aHR0cHM6Ly9ibG9nLmNzZG4ubmV0L3FxXzMyNDYwODE5_size_16_color_FFFFFF_t_70]  
下载完成后是压缩包, 解压到`~`目录下  
`$ tar -zvxf pycharm-community-2020.1.tar.gz -C ~`  
`mv pycharm pyc` \#这是为了下次使用方便  
`$ sh ~/pyc/bin/pycharm.sh` \# 打开软件pycharm  
可以使用本地的Python, 打开工程  
file->setting->选择本地工程  
打开工程,设置conda路径和, 选择RGIN用户  
![图片.png][.png]

![在这里插入图片描述][watermark_type_ZmFuZ3poZW5naGVpdGk_shadow_10_text_aHR0cHM6Ly9ibG9nLmNzZG4ubmV0L3FxXzMyNDYwODE5_size_16_color_FFFFFF_t_70 1]

## 3.2 建立软链接,pycharm安装 ##

比如我的pycharm每次需要使用命令打开

zjq@zjq:~$ sh ~/pyc/bin/pycharm.sh

因为懒所以投机取巧, 建立如下软连接  
注意一定是从~…pycharm建立到----> /usr…pycharm  
`zjq@zjq:~$ sudo ln -s ~/pyc/bin/pycharm.sh /usr/bin/pycharm`  
上面的命令含义是:  
在`/usr/bin/pycharm`目录建立新的pycharm快捷打开方式  
以后如果需要运行pycharm, 只需要在命令行输入  
`pycharm.sh`即可直接打开pycharm软件

\*需要注意的是: \*

*  `/usr/bin/`目录下存放的都是可执行文件, 将能sh, 二进制文件放入该目录下, 全局都可以进行执行而不需要定位
 *  ln -s创建的软链接, 如果想要删除, 可以找到软连接进行删除,  
    如这个软链接删除`sudo rm /usr/bin/pycharm`

# 3.4 win10安装pycharm教育版使用子系统Ubuntu的conda的环境 #

## a. 去pycharm官网注册教育版 ##

这里需要用到学校的邮箱, 千万不要想一群土B, 利用码工具到99年, 随便跟你身边的一个还在上学的小兄弟借一个账号也行呀;  
直接按照官网提示下载安装登录学校邮箱进行验证即可

## b. 在选择环境的时候, 选择Ubuntu中conda环境也很简单 ##

![在这里插入图片描述][watermark_type_ZmFuZ3poZW5naGVpdGk_shadow_10_text_aHR0cHM6Ly9ibG9nLmNzZG4ubmV0L3FxXzMyNDYwODE5_size_16_color_FFFFFF_t_70 2]

## c. 利用pycharm的好处就是 ##

能够debug, 能看每一步的每个人变量的内容, 格式

# 四. anconda与本地python冲突解决 #

*  注意: 不建议使用本地python, 建议安装完Ubuntu后首先安装anconda, 然后默认系统就是conda环境了

Python3变为anaconda中的Python的原因：安装anaconda之后里面的Python3加入到环境变量中覆盖了原来的Python3版本  
使用别名声明alias 命令来改变  
下面的命令是将本地python连接为python, 这样在命令行python就会运行本地python, 这里下次启动会失效, 因此可以将下面命令保存到`~/.bashrc`  
`alias python="/usr/bin/python3.6"`

alias conda的python可以运行下面命令

zjq@DESKTOP-O28RVV3:~$ whereis conda
    conda: /home/zjq/anaconda3/bin/conda
    alias python4=“anaconda安装目录的bin”

亲测:  
我利用`alias python="/usr/bin/python3.6"`将本地python使用python来打开, 然后conda的python默认, 即python3打开conda的python,

pip的问题  
python -m pip --version \# 显示本地python包版本  
python3 -m pip --version \# 显示condapython包版本

# 五. `jupyter notebook` #

*  安装 `pip install jupyter`

## 5.1 jupyter在conda环境中使用 ##

*  安装ipykernel `conda install ipykernel`
 *  进入对应环境 `conda activate scan`
 *  在kernel中插入环境scan  
    `python -m ipykernel install --user --name scan --display-name "在kernel中显示的名称"`
 *  运行jupyter `jupyter notebook`或者`jupyter-notebook`
 *  结果如下图所示

![在这里插入图片描述][watermark_type_ZmFuZ3poZW5naGVpdGk_shadow_10_text_aHR0cHM6Ly9ibG9nLmNzZG4ubmV0L3FxXzMyNDYwODE5_size_16_color_FFFFFF_t_70_pic_center 1]

## 5.2 jupyter登录密码设置 ##

*  method1 在配置文件中设置

jupyter notebook --generate-config   # 生成配置文件
    
    vim /home/xibeiidaxue/.jupyter/jupyter_notebook_config.py
    c.NotebookApp.token = '' # 设置为空表示登陆不需要密码
    c.NotebookApp.ip='*'  # 设置所有IP都可以访问
    c.NotebookApp.password = ""       # 密码
    c.NotebookApp.allow_root = True  # 允许根用户
    
    jupyter notebook --port 8888 # 运行特定端口8888端口

*  method2 直接设置

jupyter notebook --generate-config   # 生成配置文件
    jupyter notebook password
    # 输入两次密码

## 5.3 jupyter常用快捷键 ##

Cell命令模式目前支持的Jupyter Notebook快捷
    Enter : 转入编辑模式
    Shift-Enter : 运行本单元，选中或插入（最后一个Cell的时候）下个单元
    Ctrl-Enter : 运行本单元
    Alt-Enter : 运行本单元，在其下插入新单元
    Y : 单元转入代码状态
    M :单元转入markdown状态 （目前尚不支持R 原生状态）
    Up : 选中上方单元
    K : 选中上方单元
    Down : 选中下方单元
    J : 选中下方单元
    A : 在上方插入新单元
    B : 在下方插入新单元
    D,D : 删除选中的单元
    L : 转换行号
    Shift-Space : 向上滚动
    Space : 向下滚动
    
    Ctrl + X ：剪切/剪切行（空选定）
    Ctrl + C : 复制/复制行（空选定）
    Ctrl + Delete / Backspace :删除右边、左边的字
    Alt + ↑ / ↓ :向上/向下移动行
    Shift + Alt + ↓ / ↑ : 向上/向下复制行
    Ctrl + Shift + K : 删除行
    Ctrl + Shift + \ : 跳到匹配的括号
    Ctrl + ] / [ : 缩进/突出行
    Ctrl + ← / → : 光标到字首/字尾
    Ctrl + / : 切换行注释
    Shift + Alt + A : 切换块注释
    Ctrl + H : 查找/替换
    
    Ctrl + D : 选择一个/多个（相同）词
    Alt + 单击 : 插入多个光标
    Ctrl + Alt + ↑ / ↓ : 在上/下插入光标
    Ctrl + U : 撤消上一个光标操作
    Shift + Alt + I : 在选定的每一行的末尾插入光标
    Ctrl + L : 选择当前行
    Ctrl + Shift + L : 选择当前词的所有出现
    Ctrl + F2 ：选择当前字的所有出现
    Shift + Alt + → / Shift + Alt + ←: 展开/缩小选择
    Shift + Alt + （拖动鼠标） : 矩形块选择
    Ctrl + K Ctrl + X : 修剪尾随空格

# 六. 老Ubuntu安装Python3.6 #

# 官网下载安装包
    1. wget http://www.python.org/ftp/python/3.6.4/Python-3.6.4.tgz
    
    # 解压 
    2. tar -xvzf Python-3.6.4.tgz
    
    # 安装
    3. cd Python-3.6.4
    4. ./configure --with-ssl
    
    # 编译
    5. sudo make
    6. sudo make install
    
    # 创建软连接，先查看python3.6.4的安装路径
    7. which python3    # /usr/local/bin/python3
    8. sudo  ln -s /usr/local/bin/python3 python

# 七. python包管理 #

**问题描述**  
我们经常在一个机子上配置好环境后, 还需要去另一个机子上重新配置python环境,这样就需要每次莫名其妙的出现一些python包版本错误的问题, 为此, 可以使用下面的命令, 将当前环境中, python用到的包和版本读取到文件中,然后在通过一条命令直接插入到另一个机子的环境中, 实现两个机子中python环境的包版本统一

# 先将包版本重定义到requirement.txt中
    pip freeze > requirements.txt

# 在在另一个环境中, 安装这些包
    其中-r是从给定的版本中安装
    pip install -r requirements.txt

# 问题汇总 #

## a. jupyter无法补全 ##

jedi版本问题  
`pip install jedi==0.17`

[miniconda]: https://www.jianshu.com/p/edaa744ea47d
[watermark_type_ZmFuZ3poZW5naGVpdGk_shadow_10_text_aHR0cHM6Ly9ibG9nLmNzZG4ubmV0L3FxXzMyNDYwODE5_size_16_color_FFFFFF_t_70_pic_center]: /images/20221123/741e367f187e46469d8b31a212d4f626.png
[pip_pip_pip3]: https://blog.csdn.net/qq_40584960/article/details/86082019
[update-alternatives]: http://www.mamicode.com/info-detail-1144825.html
[Link 1]: https://www.jetbrains.com/pycharm/download/
[watermark_type_ZmFuZ3poZW5naGVpdGk_shadow_10_text_aHR0cHM6Ly9ibG9nLmNzZG4ubmV0L3FxXzMyNDYwODE5_size_16_color_FFFFFF_t_70]: /images/20221123/f29cdf303964471ca3870ae4898aeba6.png
[.png]: /images/20221123/4303d5f4837b4385b6996a17812d3bd2.png
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[watermark_type_ZmFuZ3poZW5naGVpdGk_shadow_10_text_aHR0cHM6Ly9ibG9nLmNzZG4ubmV0L3FxXzMyNDYwODE5_size_16_color_FFFFFF_t_70_pic_center 1]: /images/20221123/92c541b1e15141f4899b2b7d6afd2236.png