编译运行BSR/bench源码

以你之姓@ 2022-08-13 03:59 164阅读 0赞

Berkeley图像分割数据库及相应代码是在64位Linux系统下开发的，包含C和Matlab代码。今天的任务是在刚装的32位Ubuntu12.04下编译运行该代码包。  
  
第一步，需要将 \\BSR\\bench\\source 中的.cc文件编译为.mex文件替换 BSR\\bench\\benchmarks 中的.mexa64 文件。.mexa64文件表示在64位Linux系统下编译好的C或Fortran函数，它们可以像标准的M文件一样在Matlab环境中调用。编译后的Mex文件带有与操作平台相关的特定的文件扩展名。例如，在Windows平台下，Mex文件扩展名为dll，在Sun Solaris平台下为mexsol。在32位Linux系统下，扩展名为mexglx。  
  
1、安装gcc和g++。  
可通过软件中心搜索gcc、g++，安装，也可以在终端通过命令行安装：  
sudo apt-get install gcc-4.6 g++-4.6  
Ubuntu12.04已默认安装了gcc-4.6和g++-4.6，记住这里的版本号4.6。  
  
2、在matlab命令窗口输入：  
mex -setup  
出现如下内容并作相应选择：

The options files available for mex are:

1: /usr/local/MATLAB/R2012a/bin/mexopts.sh : 
    Template Options file for building gcc MEX-files
    
    
    0: Exit with no changes
    
    Enter the number of the compiler (0-1):
    1
    
    Overwrite /home/cai/.matlab/R2012a/mexopts.sh ([y]/n)? 
    y
    
    然后在终端输入：sudo gedit /usr/local/MATLAB/R2012a/bin/mexopts.sh
    编辑该文件，将其中的 CC='gcc'，CXX='g++' 和 FC='gfortran'分别改为 CC='gcc-4.6'，CXX='g++-4.6' 和 FC='gfortran-4.6'（依具体版本号改动）。
    
    然后运行BSR\bench\source下的build.sh，这时提示编译到correspondPixels.cc文件的mxCreateScalarDouble这一行出错，该函数未声明。
    一遇到具体代码有错，第一反应就是糟了：（ 还好没灰心，打开correspondPixels.cc文件，定位到该行，上网搜一搜，发现有一个函数是mxCreateDoubleScalar()。抱着试一试的心理，把该文件中涉及到该函数的地方都改为mxCreateDoubleScalar()。再运行build.sh，这次就成功了：）
    
    接下来检查一下编译成功了生成的correspondPixels.mexglx是否被复制到BSR/bench/benchmarks文件夹下替换了原来的correspondPixels.mexa64，如果没有，手动复制一下（sudo cpBSR/bench/source/correspondPixels.mexglx /BSR/bench/benchmarks/correspondPixels.mexglx）。
    
    接下来就可以运行BSR/bench/下的test_benchs.m文件了。这时还会出现代码的报错，而且因为下载了多个形式的源码包，如果都解压并且没有合并，若都添加到Matlab路径中，由于存在同名文件，很容易出现调用的问题，所以建议调试某个文件夹代码的时候把其余不相关的类似文件夹从路径移除。另外还要特别注意Matlab运行时的当前目录，因为代码中多次用到相对路径，若当前目录不对，代码运行也会出错（当前目录应为BSR/bench/）。
    
    这是运行会发现[p,n,e,v]=fileparts(inFile)参数过多的错误，将其改为[p,n,e]=fileparts(inFile)即可，不知道是不是笔误：）
    
    这期间还出现过一个问题是/lib/libc.so.6: not found
    解决方法是：
    先定位该文件所在位置：locate libc.so.6 -->得到 /lib/i386-linux-gnu/libc.so.6
    然后：sudo ln -s /lib/i386-linux-gnu/libc.so /lib/libc.so.6  
    
    到此，就可以成功运行test_benchs.m文件了：）