android 解析并显示dicom文件的数据和图像

柔光的暖阳◎ 2022-06-12 02:07 814阅读 0赞

# android解析并显示dicom文件的数据和图像 #

Dicom全称是医学数字图像与通讯，这里android程序代码解析diocm格式文件并显示dicom的图片和数据。  
这里解析dicom使用的是dcm4che3的jar包来解析，还要另外导入一个slf的jar包。  
程序效果：  
![1][]

程序实现数据的基本显示，和图片可放大缩小效果。  
但是也看到程序中有些dicom文件没有图片显示，是因为不能读取压缩的图片的dicom文件的图片数据的读取！

程序代码：  
布局文件就不显示了，上面多个TextView，下面是一个Photoview。  
java代码：

package com.liwenzhi.dcm;
    
    import android.app.Activity;
    import android.graphics.Bitmap;
    import android.os.Bundle;
    import android.util.Log;
    import android.view.View;
    import android.widget.TextView;
    import com.liwenzhi.dcm.photoview.PhotoView;
    import org.dcm4che3.android.Raster;
    import org.dcm4che3.android.RasterUtil;
    import org.dcm4che3.android.imageio.dicom.DicomImageReader;
    import org.dcm4che3.data.Attributes;
    import org.dcm4che3.data.Tag;
    import org.dcm4che3.data.VR;
    import org.dcm4che3.io.DicomInputStream;
    
    import java.io.*;
    
    /**
     * 解析并显示dicom文件的示例
     */
    public class MyActivity extends Activity {
    
        PhotoView iv;
        TextView tv_picture;
        TextView tv_name;
        TextView tv_birthday;
        TextView tv_institution;
        TextView tv_station;
        TextView tv_StudyDescription;
        TextView tv_SeriesDescription;
        TextView tv_manufacturerModelName;
        TextView tv_manufacturer;
        TextView tv_StudyDate;
        int number = 1;
    
        @Override
        public void onCreate(Bundle savedInstanceState) {
            super.onCreate(savedInstanceState);
            setContentView(R.layout.main);
            initView();
            initEvent();
        }
    
        private void initView() {
            iv = (PhotoView) findViewById(R.id.iv);
            tv_picture = (TextView) findViewById(R.id.tv_picture);
            tv_name = (TextView) findViewById(R.id.tv_name);
            tv_birthday = (TextView) findViewById(R.id.tv_birthday);
            tv_institution = (TextView) findViewById(R.id.tv_institution);
            tv_station = (TextView) findViewById(R.id.tv_station);
            tv_StudyDescription = (TextView) findViewById(R.id.tv_StudyDescription);
            tv_SeriesDescription = (TextView) findViewById(R.id.tv_SeriesDescription);
            tv_manufacturer = (TextView) findViewById(R.id.tv_manufacturer);
            tv_manufacturerModelName = (TextView) findViewById(R.id.tv_manufacturerModelName);
            tv_StudyDate = (TextView) findViewById(R.id.tv_StudyDate);
    
        }
    
    
        private void initEvent() {
    
    
        }
    
    
        public void next(View view) {
            //清空数据
            tv_name.setText("");
            tv_birthday.setText("");
            tv_institution.setText("");
            tv_station.setText("");
            tv_StudyDescription.setText("");
            tv_manufacturer.setText("");
            tv_manufacturerModelName.setText("");
            tv_StudyDate.setText("");
            tv_SeriesDescription.setText("");
            iv.setImageResource(R.drawable.ic_launcher);
    
            String fileName = "test" + number + ".dcm";
            tv_picture.setText(fileName);
            //加载图片
            btnLoadClicked(fileName);
    
            number++;
            if (number == 10)
                number = 1;
    
        }
    
    
        void btnLoadClicked(String fileName) {
            String testFileName = this.getCacheDir().getAbsolutePath() + "/" + fileName;
            File file = new File(testFileName);
            if (file.exists())
                file.delete();
            InputStream is;
            try {
                is = getAssets().open(fileName);
                copyFile(is, file);      //从assets中复制到本地路径
                readFile(testFileName); //读取本地路径中的dicom文件
            } catch (IOException e) {
                e.printStackTrace();
            }
    
        }
    
        /**
         * 复制文件的代码
         */
        void copyFile(InputStream is, File dstFile) {
            try {
    
                BufferedInputStream bis = new BufferedInputStream(is);
                BufferedOutputStream bos = new BufferedOutputStream(
                        new FileOutputStream(dstFile), 1024);
                byte buf[] = new byte[1024];
                int c = 0;
                c = bis.read(buf);
                while (c > 0) {
                    bos.write(buf, 0, c);
                    c = bis.read(buf);
                }
                bis.close();
                bos.close();
    
            } catch (Exception e) {
                e.printStackTrace();
            }
    
        }
    
        /**
         * 读取文件数据
         */
        public void readFile(String filePath) {
            DicomImageReader dr = new DicomImageReader();
            try {
                File file = new File(filePath);
                //dcm文件输入流
                DicomInputStream dcmInputStream = new DicomInputStream(file);
                //属性对象
                Attributes attrs = dcmInputStream.readDataset(-1, -1);
                //输出所有属性信息
                Log.e("TAG", "输出所有属性信息1:" + attrs);
    
                //获取行
                int row = attrs.getInt(Tag.Rows, 1);
                //获取列
                int columns = attrs.getInt(Tag.Columns, 1);
                //窗宽窗位
                float win_center = attrs.getFloat(Tag.WindowCenter, 1);
                float win_width = attrs.getFloat(Tag.WindowWidth, 1);
                Log.e("TAG", "" + "row=" + row + ",columns=" + row + "row*columns = " + row * columns);
    
                Log.e("TAG", "" + "win_center=" + win_center + ",win_width=" + win_width);
                //获取像素数据 ，这个像素数据不知道怎么用！！！，得到的是图片像素的两倍的长度
                //后面那个 raster.getByteData()是图片的像素数据
                byte[] b = attrs.getSafeBytes(Tag.PixelData);
                if (b != null) {
                    Log.e("TAG", "" + "b.length=" + b.length);
                } else {
                    Log.e("TAG", "" + "b==null");
                }
    
                //修改默认字符集为GB18030
                attrs.setString(Tag.SpecificCharacterSet, VR.CS, "GB18030");//解决中文乱码问题
    
                Log.e("TAG", "输出所有属性信息2:" + attrs);
                String patientName = attrs.getString(Tag.PatientName, "");
                tv_name.setText("姓名：" + patientName);
    
                //生日
                String patientBirthDate = attrs.getString(Tag.PatientBirthDate, "");
                tv_birthday.setText("生日：" + patientBirthDate);
    
                //机构
                String institution = attrs.getString(Tag.InstitutionName, "");
                tv_institution.setText("机构：" + institution);
    
                //站点
                String station = attrs.getString(Tag.StationName, "");
                tv_station.setText("站点：" + station);
    
                //制造商
                String Manufacturer = attrs.getString(Tag.Manufacturer, "");
                tv_manufacturer.setText("制造商：" + Manufacturer);
    
                //制造商模型
                String ManufacturerModelName = attrs.getString(Tag.ManufacturerModelName, "");
                tv_manufacturerModelName.setText("制造商模型：" + ManufacturerModelName);
    
    
                //描述--心房
                String description = attrs.getString(Tag.StudyDescription, "");
                tv_StudyDescription.setText("描述--心房：" + description);
                //描述--具体
                String SeriesDescription = attrs.getString(Tag.SeriesDescription, "");
                tv_SeriesDescription.setText("描述--具体：" + SeriesDescription);
    
                //描述时间
                String studyData = attrs.getString(Tag.StudyDate, "");
                tv_StudyDate.setText("描述时间：" + studyData);
    
    
                dr.open(file);
    //            Attributes ds = dr.getAttributes();
    //            String wc = ds.getString(Tag.WindowCenter);
    //            String ww = ds.getString(Tag.WindowWidth);
    //            Log.e("TAG", "" + "wc=" + wc + ",ww=" + ww);
                Raster raster = dr.applyWindowCenter(0, (int) win_width, (int) win_center);
    //            Log.e("TAG", "" + "raster.getWidth()=" + raster.getWidth() + ",raster.getHeight()=" + raster.getHeight());
    //            Log.e("TAG", "" + "raster.getByteData().length=" + raster.getByteData().length);
    
    //            Bitmap bmp = RasterUtil.gray8ToBitmap(raster.getWidth(), raster.getHeight(), raster.getByteData());
    //            Log.e("TAG", "b==raster.getByteData()" + (b == raster.getByteData()));
                Bitmap bmp = RasterUtil.gray8ToBitmap(columns, row, raster.getByteData());
                iv.setImageBitmap(bmp);
    
            } catch (Exception e) {
                Log.e("TAG", "" + e);
            }
    
        }
    
    
    }

上面代码中有些注释了的代码，说的是使用另一种方法获取WindowCenter和WindowWidth。

上面还有一句重要的代码：

//修改默认字符集为GB18030
      attrs.setString(Tag.SpecificCharacterSet, VR.CS, "GB18030");//解决中文乱码问题

默认情况下，有些dicom文件没有设置编码方式，如果有中文字符出现，获取会得到乱码，这里编码方式只能设置成“GB08030”，才能成功解析中文数据，不能设置”GBK“或”UTF-8“。

解析没有压缩图片的dicom文件，使用dcm4che3来解析是没有问题的。  
但是解析有压缩图片的dicom文件就不行了，  
目前也是没有任何框架或代码能实现直接用代码解析压缩图片的dicom文件。

网上有些是在java服务器端解压dicom后再读取，或使用一些工具解压dicom，  
反正目前用代码只能读取到没有压缩图片的dicom文件。

我的代码和jar包，dicom文件等数据请看我的项目。  
地址：[https://github.com/liwenzhi/dcm4che3Demo][https_github.com_liwenzhi_dcm4che3Demo]

其中，dicom还有很多其他的tag数据，这个具体要看dicom文件详细解析了。

下面是某些tag，以及tag对应的VR。

string getVR(string tag)
    {
        switch (tag)
        {
            case "0002,0000"://文件元信息长度
                return "UL";
                break;
            case "0002,0010"://传输语法
                return "UI";
                break;
            case "0002,0013"://文件生成程序的标题
                return "SH";
                break;
            case "0008,0005"://文本编码
                return "CS";
                break;
            case "0008,0008":
                return "CS";
                break;
            case "0008,1032"://成像时间
                return "SQ";
                break;
            case "0008,1111":
                return "SQ";
                break;
            case "0008,0020"://检查日期
                return "DA";
                break;
            case "0008,0060"://成像仪器
                return "CS";
                break;
            case "0008,0070"://成像仪厂商
                return "LO";
                break;
            case "0008,0080":
                return "LO";
                break;
            case "0010,0010"://病人姓名
                return "PN";
                break;
            case "0010,0020"://病人id
                return "LO";
                break;
            case "0010,0030"://病人生日
                return "DA";
                break;
            case "0018,0060"://电压
                return "DS";
                break;
            case "0018,1030"://协议名
                return "LO";
                break;
            case "0018,1151":
                return "IS";
                break;
            case "0020,0010"://检查ID
                return "SH";
                break;
            case "0020,0011"://序列
                return "IS";
                break;
            case "0020,0012"://成像编号
                return "IS";
                break;
            case "0020,0013"://影像编号
                return "IS";
                break;
            case "0028,0002"://像素采样1为灰度3为彩色
                return "US";
                break;
            case "0028,0004"://图像模式MONOCHROME2为灰度
                return "CS";
                break;
            case "0028,0010"://row高
                return "US";
                break;
            case "0028,0011"://col宽
                return "US";
                break;
            case "0028,0100"://单个采样数据长度
                return "US";
                break;
            case "0028,0101"://实际长度
                return "US";
                break;
            case "0028,0102"://采样最大值
                return "US";
                break;
            case "0028,1050"://窗位
                return "DS";
                break;
            case "0028,1051"://窗宽
                return "DS";
                break;
            case "0028,1052":
                return "DS";
                break;
            case "0028,1053":
                return "DS";
                break;
            case "0040,0008"://文件夹标签
                return "SQ";
                break;
            case "0040,0260"://文件夹标签
                return "SQ";
                break;
            case "0040,0275"://文件夹标签
                return "SQ";
                break;
            case "7fe0,0010"://像素数据开始处
                return "OW";
                break;
            default:
                return "UN";
                break;
        }
    }

上面程序的后台其实是有打Log数据的，  
如图：  
![2][]  
上面图说的tag包含的数据，其实就是整个dataElement中的数据值。

可以根据输出的dicom数据，看看你需要那个tag信息，再用代码获取，也是可以的。

dicom传输的相关知识也只能介绍到这里，很多知识还没有理解透彻，只是把这些知识罗列出来，给大家参考一下！

## dicom文件解析知识的其他地址： ##

### 1.dicom文件详解 ###

[http://blog.csdn.net/wenzhi20102321/article/details/75127362][http_blog.csdn.net_wenzhi20102321_article_details_75127362]

### 2.dicom文件的值类型VR详解 ###

[http://blog.csdn.net/wenzhi20102321/article/details/75127140][http_blog.csdn.net_wenzhi20102321_article_details_75127140]

### 3.dicom文件tag详解 ###

[http://blog.csdn.net/wenzhi20102321/article/details/75127101][http_blog.csdn.net_wenzhi20102321_article_details_75127101]

### 4.android 解析并显示dicom文件的数据和图像 ###

[http://blog.csdn.net/wenzhi20102321/article/details/75040225][http_blog.csdn.net_wenzhi20102321_article_details_75040225]

### 5.java代码使用ImageJ解析dicom文件成图片 ###

[http://blog.csdn.net/wenzhi20102321/article/details/74995084][http_blog.csdn.net_wenzhi20102321_article_details_74995084]

前面5个是我自己写的，后面是一些我自己看过的相关资料：

### 6.Dicom文件解析 ###

[http://blog.csdn.net/leaf6094189/article/details/8510325][http_blog.csdn.net_leaf6094189_article_details_8510325]

### 7.使用dcm4che3获取Dicom的bmp格式缩略图 ###

[http://blog.csdn.net/Kerrigeng/article/details/60866656][http_blog.csdn.net_Kerrigeng_article_details_60866656]

### 8.使用dcm4che3解析DICOM中，中文乱码问题 ###

[http://blog.csdn.net/Kerrigeng/article/details/53942846][http_blog.csdn.net_Kerrigeng_article_details_53942846]

### 9.使用dcm4che3对jpeg压缩的dcm文件进行解压 ###

[http://blog.csdn.net/Kerrigeng/article/details/62215647][http_blog.csdn.net_Kerrigeng_article_details_62215647]

### 10.DICOM的常用Tag分类和说明 ###

[http://www.cnblogs.com/stephen2014/p/4579443.html][http_www.cnblogs.com_stephen2014_p_4579443.html]

### 11.dicom的大牛zssure的博客，几十篇文章 ###

[http://blog.csdn.net/zssureqh/article/category/1389985][http_blog.csdn.net_zssureqh_article_category_1389985]

### 12.dicom协议中文文档下载 ###

[http://download.csdn.net/detail/wenzhi20102321/9897014][http_download.csdn.net_detail_wenzhi20102321_9897014]

### 13.Sante DICOM Editor 4，查看dicom文件的工具，直接打开用 ###

[http://download.csdn.net/detail/wenzhi20102321/9895616][http_download.csdn.net_detail_wenzhi20102321_9895616]

# 共勉：在最好的年龄去干些最有意义的事情。 #

[1]: http://i.imgur.com/axNDpFt.gif
[https_github.com_liwenzhi_dcm4che3Demo]: https://github.com/liwenzhi/dcm4che3Demo
[2]: http://i.imgur.com/JEF61G4.png
[http_blog.csdn.net_wenzhi20102321_article_details_75127362]: http://blog.csdn.net/wenzhi20102321/article/details/75127362
[http_blog.csdn.net_wenzhi20102321_article_details_75127140]: http://blog.csdn.net/wenzhi20102321/article/details/75127140
[http_blog.csdn.net_wenzhi20102321_article_details_75127101]: http://blog.csdn.net/wenzhi20102321/article/details/75127101
[http_blog.csdn.net_wenzhi20102321_article_details_75040225]: http://blog.csdn.net/wenzhi20102321/article/details/75040225
[http_blog.csdn.net_wenzhi20102321_article_details_74995084]: http://blog.csdn.net/wenzhi20102321/article/details/74995084
[http_blog.csdn.net_leaf6094189_article_details_8510325]: http://blog.csdn.net/leaf6094189/article/details/8510325
[http_blog.csdn.net_Kerrigeng_article_details_60866656]: http://blog.csdn.net/Kerrigeng/article/details/60866656
[http_blog.csdn.net_Kerrigeng_article_details_53942846]: http://blog.csdn.net/Kerrigeng/article/details/53942846
[http_blog.csdn.net_Kerrigeng_article_details_62215647]: http://blog.csdn.net/Kerrigeng/article/details/62215647
[http_www.cnblogs.com_stephen2014_p_4579443.html]: http://www.cnblogs.com/stephen2014/p/4579443.html
[http_blog.csdn.net_zssureqh_article_category_1389985]: http://blog.csdn.net/zssureqh/article/category/1389985
[http_download.csdn.net_detail_wenzhi20102321_9897014]: http://download.csdn.net/detail/wenzhi20102321/9897014
[http_download.csdn.net_detail_wenzhi20102321_9895616]: http://download.csdn.net/detail/wenzhi20102321/9895616